Doctorat

Doctorant : Gaël Toubon

Titre : Facteurs de variation précoce du microbiote intestinal des enfants de 3 ans et relations avec l’évolution de la corpulence : données des cohortes EPIPAGE 2 et ELFE

Encadrants : Marie-Aline Charles et Julio Aires

Ecole doctorale : ED 393 Épidémiologie et Sciences de l’Information Biomédicale, Université Paris Cité

Promotion : 2020

Financement : Allocation doctorale

Sujet de thèse :

Le microbiote intestinal joue un rôle important sur la santé et le développement de l’hôte. Des données de la littérature montrent que des déterminants précoces en début de vie peuvent influencer le développement du microbiote et par conséquent, la santé de l’hôte à court et long terme. Pour cette thèse, ont été mobilisé les données de deux cohortes de naissance nationales françaises : EPIPAGE 2 (enfants prématurés) et ELFE (population générale). A partir des échantillons de selles collectés dans le cadre du suivi de ces cohortes, le microbiote intestinal a été caractérisé par une approche de métagénomique ciblée de l’ADNr 16S bactérien. Ces travaux de thèse permettent de mieux comprendre l’évolution du microbiote intestinal du nouveau-né prématuré durant la petite enfance et souligne l’importance des facteurs précoces dans le développement du microbiote intestinal ainsi que ses liens avec le développement de la corpulence durant la petite enfance.

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